马德里体系的优势主要体现在以下几个方面：
1、手续简便
商标申请人可仅通过向主管局提交一份申请而在多个被指定国同时获得商标保护，申请手续简便。
2.费用低廉
马德里商标国际注册的费用主要包括两部分：一是基础注册费，二是指定国家的费用。申请人可以在一份申请中指定一个或多个成员国，而无论指定一个成员国还是指定全部成员国，申请人均只需缴纳一份基础注册费。在单一国家注册中，申请人需向每一个被申请国提交商标注册申请并分别缴纳费用，除商标注册的相关规费外，还可能产生律师费、翻译费等。实践表明，通过马德里体系申请商标注册比逐一申请在费用上更为经济。而且，申请的国家越多，相对节省的费用就越多。
3.申请注册周期有保障，时间快捷
根据马德里协定和议定书的规定，被指定缔约方主管局必须遵守自国际注册通知之日起12个月或18个月的驳回期限，超过这一期限，则视为自动核准保护。也就是说申请人在12个月或18个月的时间，就能知道自己的国际注册商标在各国是否能得到保护。
4.便于商标信息查询和管理
在马德里商标国际注册中，每件国际注册商标只有一个国际注册号。此后该商标的所有国际注册后续业务，包括后期指定、变更、转让、删减、续展、放弃等，都基于该国际注册号，并由国际局对每件国际注册商标在各阶段的情况进行登记。申请人可以根据自己商标的国际注册号，通过国际局的网站进行查询，及时明确地掌握该商标在马德里各成员国的最新情况，便于申请人掌握、使用和管理自己的商标。
综上，通过马德里国际注册，商标申请人只需要通过一个机构（即世界知识产权组织国际局）、使用一种语言（目前我国只接受法语和英语作为申请语言）、提交一份申请、缴纳一次费用，就可以向马德里体系所有缔约方提出商标注册申请，从而免去了向这些缔约方商标注册机关分别递交申请的烦琐程序。
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